Današnji Klinički zavod za patologiju i citologiju utmeljen je 1958. godine u tadašnjoj Vojnoj bolnici kao Patološko anatomsko odjeljenje. Prvi patolog Radenko Apić, dr. med. dolazi na Odjel 1965. godine. Do tada su patohistološku dijagnostiku i obdukcije obavljali patolozi Zavoda za patologiju Medicinskog fakulteta u Zagrebu. Od 1979. do 1997. godine Odjel vodi dr. sc. Đuro Vranešić, prim. koji osniva Laboratorij za elektronsku mikroskopiju.