Početci pulmološke djelatnosti u Kliničkoj bolnici Dubrava sežu u razdoblje nakon završetka Drugog svjetskog rata, 1945. godine. Dijagnostičko-terapeutska služba s laboratorijem za funkcionalno ispitivanje pluća formira se 1953. i pruža usluge skoro svim bolnicama i ustanovama u Zagrebu i izvan njega. Do 1975. na odjelu se vrše bronhoskopija, bronhografija, plinska analiza krvi, transtorakalna i tranhbronhalna punkcija, biopsija sluznice bronha, alergološko testiranje, EKG, fizikalna terapija i administriranje inhalacijske terapije. Odjel postaje dio Klinike za unutarnje bolesti 1995. godine.
Od 1996. do 2020. pod vodstvom prof. dr. sc. Nevena Tudorića djelatnost pulmologije KBD etablira se u hrvatskoj pulmologiji i na međunarodnoj razini sudjelovanjem u brojnim studijskim stručno-znanstvenim istraživanjima. Zavod sudjeluje u svim nastavnim aktivnostima Klinike, vrše se svi pulmološki dijagnostički i terapijski postupci, ali i visokosofisticirane metode dijagnostike i liječenja. Zavod za pulmologiju KB Dubrava prvi je u Republici Hrvatskoj izveo i implementirao endobronhalnu ultrazvučnu dijagnostiku. Pod mentorstvom prof. dr. sc. Tudorića troje liječnika subspecijalista obranilo je doktorske disertacije. Razina stručnosti potvrđena je i međunarodnom validacijom – troje liječnika posjeduje europski pulmološki certifikat (HERMES) te jedan liječnik europski certifikat za endobronhalni ultrazvuk.
Tijekom pandemije bolesti COVID-19, svi liječnici Zavoda imali su značajnu ulogu u organizaciji i pružanju zdravstvene zaštite velikom broju oboljelih u Respiracijskom i Intenzivističkom centru. Pri Zavodu je u jesen 2020. osnovana prva post-COVID dnevna bolnica u Republici Hrvatskoj koja je po opsegu dijagnostike i broju bolesnika o kojima skrbi najznačajniji i najiskusniji post-COVID centar u državi.